Quatre mois après la mort de Hank Crawford et de son frère Roman, Jane est redevenue Remi, agent active de Sandstorm. Elle découvre que le ZIP, qui a effacé sa mémoire, l'empoisonne lentement alors qu'elle tente de démanteler le FBI de l'intérieur. Pendant ce temps, une nouvelle menace voit le jour avec Madeline Burke, qui prépare un plan secret contre le gouvernement américain. Elle reçoit l'aide de Zapata dans son entreprise criminelle. La saison 4 mène Jane, jouée par Jaimie Alexander, dans les rues de Tokyo avant de multiplier les scènes d'action, avec l'équipe du FBI, dans toute l'Europe et l'Amérique du Sud.