A história se foca nos dois estudantes do dojo Kyokugenryu Karate: Ryo Sakazaki e Robert Garcia. Ryo é filho do criador da arte marcial do dojo, Takuma Sakazaki, enquanto Robert é filho de uma família bilionária da Itália.
Quando a irmã de Ryo, Yuri Sakazaki, é raptada por Mr. Big e seus capangas. Ryo e Robert precisam lutar por South Town para encontrar o paradeiro de Yuri e o responsável por tudo aquilo.
O jogo faz diversas alusões a Fatal Fury, com o segundo jogo sendo uma óbvia ponte entre as duas séries, sendo Geese Howard o antagonista final.
Por outro lado o terceiro jogo passa a se focar em Robert Garcia em uma história totalmente diferente, um elenco novo e se passando em uma área fictícia do México ao invés de South Town.
Vale lembrar que na continuidade de The King of Fighters, os eventos da série se passam paralelamente a Fatal Fury ao invés de uma década antes, explicando o porque dos personagens de Art of Fighting continuarem jovens junto dos personagens de Fatal Fury.
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