Le groupe terroriste État Islamique entend s'imposer progressivement en Somalie, à la manière de son implantation réussie au Nigeria. L'ÉI projette de créer une branche en Afrique de l'Est appelée "Le Petit Émirat". Les autorités somaliennes tentent tant bien que mal de contenir cette menace, et rappellent les dangers de l'émergence d'une alliance entre al-Chabab et le groupe État Islamique. En 2012, al-Chabab, le groupe militant terroriste basé en Somalie avait fait allégeance au réseau terroriste Al Qaïda, et avait pris le contrôle de la capitale Mogadiscio et des autres grandes villes du pays.
