Le film confronte les points de vue des deux parties : d’un côté les partisans du "dessein intelligent", au premier rang desquels Philip E. Johnson, considéré comme le père de cette "théorie" controversée, le biochimiste Michael Behe et le mathématicien William Dembski ; de l’autre les défenseurs de l’évolution, notamment le biologiste "néodarwinien" Richard Dawkins et David Attenborough, le pionnier anglais du documentaire animalier.
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