Alors que les Stone s'apprêtent à rentrer aux Etats-Unis après avoir passé des vacances à la Jamaïque, un problème de surbooking les amène à se répartir sur deux vols différents. Les parents de Michaela et la fille de son frère Ben, Olive, montent à bord d'un vol régulier. Michaela, Ben et le fils de celui-ci, Cal, embarquent sur un vol plus tardif. A leur arrivée, Michaela, Ben et Cal apprennent que leur avion est porté disparu depuis plus de cinq ans. Tous les passagers sont présumés morts. Les services d'enquête fédéraux tentent de comprendre ce qui a pu se passer. Les miraculés, qui n'ont pas pris une ride, sont victimes de phénomènes étranges. Une série aussi mystérieuse que "Lost". "Manifest" est un projet de Jeff Rake, qui a également coproduit "Bones" et "Boston Justice".