Komi-san est la plus jolie fille du lycée. Dans la cour ou dans les couloirs, les gens ne peuvent s'empêcher de la fixer du regard, en admiration devant sa beauté et sa prestance. Elle ne semble s'intéresser à rien ni personne, et son côté froid et mystérieux ne fait qu'augmenter les fantasmes de ses camarades. Cependant, Tadano Hitohito connaît son secret. La vérité, c'est qu'elle est très timide et qu'elle a un grand souci pour communiquer avec ses semblables. Komi-san, qui tient absolument à corriger cette facette de sa personnalité, va être aidée par Hitohito, qui va petit à petit lui apprendre à s'adapter aux gens qui l'entourent