Kekecewaan terhadap komposisi Kabinet Indonesia Maju juga disuarakan pengurus pusat Muhammadiyah, yang kecewa karena Presiden Jokowi yang memilih Nadiem Makarim sebagai Menteri Pendidikan dan Kebudayaan.
Menurut Wakil Ketua Majelis Tabligh Pengurus Pusat Muhammadiyah, Fahmi Salim, posisi Mendikbud biasanya dijabat oleh perwakilan Muhammadiyah, yang disebutnya sarat dengan faktor historis yang lekat dengan peran Muhammadiyah.
