À partir de la 6e saison (2006-2007), F3X a revêtu un nouvel habillage. La musique du générique, tout comme les images de l'indicatif, ont fait peau neuve. Les saynètes ont abandonné les X-Men pour puiser dans les images de Teen Titans, de La Ligue des Justiciers mais aussi de The Batman ou de Superman. Nombre de comédiens de la VF originale ont repris du service pour ces saynètes redoublées. L'émission a gagné un tout petit peu en sobriété. Côté présentation, les enchaînements étaient assurés par la voix de Patrick Poivey (célèbre voix de Bruce Willis).