Sakura est une petite fille de 12 ans comme les autres, pourtant dès le début du manga, nous sommes plongés au coeur d'une action bien étrange. Tout commença le jour où Sakura entend d'étranges bruits au sous sol et décide d'aller voir ce qui s'y passe. C'est alors qu'elle tombe sur un étrange livre qui brille. Lorsqu'elle l'ouvre, elle y trouve des cartes et prononce le nom de l'une d'entre elles (Windy). C'est ainsi que toutes les autres s'envolent. Un étrange petit être sort alors de la couverture. Kéro, Kérobéros de son vrai nom, était chargé de garder les cartes, mais malheureusement, s'étant endormi, il n'a pu les empécher de disparaître... Ces cartes magiques, créés par un sorcier, Clow Lead, commettent des actes malfaisants si elles sont en liberté. Et c'est Sakura qui se voit confier la mission de les retrouver "Card Captor Sakura" est née!