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Votre ordinateur peut aider à concevoir un vaccin contre le Sida : http://www.boinc-af.org/content/view/667/219/ Le Programme commun des Nations Unies sur le VIH/SIDA estime que plus de 40 millions de personnes dans le monde sont porteuses du VIH, le virus de l'immunodéficience humaine. Parmis elles, 4,3 millions ont contracté la maladie en 2006 soit 400 000 de plus qu'en 2004. Malgré un accès amélioré aux antirétroviraux, le VIH poursuit sa progression meurtrière. Dans les pays en développement, les antirétroviraux restent encore peu accessibles. Selon l'OMS, l'ONUSida et l'Unicef seul 28% des malades des pays à revenu faible ou intermédiaire bénéficient d'une trithérapie (contre 85% en France). Le Laboratoire Moléculaire du Professeur Arthur J. Olson, de l'institut The Scripps Research Institute (TSRI) étudie les moyens informatiques de concevoir de nouveaux médicaments anti-VIH à partir des structures moléculaires. Le calcul consiste à comparer des centaines de milliers de molécules naturelles à des centaines de protéases du VIH. La recherche peut alors se résumer à rechercher une molécule qui pourrait parfaitement s'adapter à une protéase. C'est un peu comme si on avait devant nous des centaines de milliers de clés et une centaine de serrures, les différentes combinaisons sont extrêment nombreuses. C'est Emil Fischer, qui en 1894, a proposé l'idée que les enzymes et leurs substrats doivent s'adapter ensemble comme une serrure et une clef. Si les recherches aboutissent les éventuels vaccins ou médicaments seraient accessibles aux pays pauvres, qui auraient les droits pour les produire et les distribuer sur place à la population atteinte par le virus.

Dans cette vidéo, le Dr Ram Samudrala, professeur associé de bio-informatique et chercheur principal à l'Université de Washington présente sa recherche. L'objectif du projet est de prédire, au moyen de l'informatique, la structure des 40.000 protéines entrant dans la composition des principales variétés de riz. Ces prédictions permettront de comprendre les propriétés de ces protéines et leurs interactions au sein du grain de riz. Les caractéristiques intéressantes sont identifiées par des marqueurs génétiques spécifiques, ces marqueurs sont souvent situés à proximité de gènes dormant dans le génome de variétés peu ou pas cultivées pour différentes raisons (mauvais rendement, peu de goût,...). En croisant ces variétés délaissées avec d'autres, il est possible d'obtenir des variétés plus nutritives avec des rendements plus élevés, une résistance accrue aux maladies et aux parasites, ... Cette technique appelée Hybridation Intelligente ou sélection assistée par marqueurs est souvent présentée comme l'alternative verte aux OGM. Elle permet une amélioration naturelle des espèces puisque l'on réalise un croisement entre deux variétés d'une même espèce (comme cela se pratique depuis que l'Homme a inventé l'agriculture). Aucun segment génétique étranger (virus, résistances antibiotiques...) n'est ajouté à l'espèce comme cela peut être le cas avec les OGM. L'informatique n'est là que pour identifier les marqueurs génétiques les plus prometteurs dormant au sein de variétés souvent délaissées, ensuite le croisement entre les variétés sélectionnées se fait naturellement. Cette technique a par exemple déjà permis de découvrir des laitues qui résistent aux pucerons ou des tomates qui restent fraîches quatre fois plus longtemps. http://www.boinc-af.org/content/view/947/219/

Dans cette vidéo, David Baker et son équipe de recherche de l'Université de l'Etat de Washington nous expliquent les tenants et aboutissants du projet Rosetta@home (BOINC). Rosetta@home est un projet de recherche qui tente d'améliorer les techniques de repliement des protéines. En savoir plus : http://www.boinc-af.org/content/view/26/219/ Réalisation, Laura Lynn Gonzalez Images de synthèses et explications de David Baker, Divya Bhat, David Kim, Bill Schief et Rhiiju Das.